大豆基因組數據盡管可以提供大量信息，但不足以闡明具體生物學功能，蛋白質是生物過程的主要執行者，蛋白質組研究在揭示植物表型背后的分子機制中扮演著不可替代的角色，因此獲取高質量的大豆定量蛋白質組數據對研究大豆蛋白質表達調控機制具有重要意義。 

　　該科研團隊對大豆14個器官中超過12800個基因的蛋白質水平進行了量化分析，并同時完成了同批14個器官的轉錄組水平鑒定及N6-腺苷酸甲基化（m6A）修飾的定量圖譜繪制。對圖譜數據的分析發現，蛋白質在不同組織間的相關性高于轉錄本，大量基因在轉錄與蛋白層面并未呈現顯著關聯，蛋白質與轉錄本豐度在不同器官間存在顯著差異。研究還闡明了 m6A 修飾在大豆中的全局分布及分子功能，鑒定出調控大豆發育的關鍵 m6A 調控因子MTBa，表明蛋白質組數據能有效助力大豆新基因的發現。 

　　在后基因組時代，該研究將大豆研究焦點從基因和轉錄層面，轉向蛋白質組層面，并通過探討表觀因子在轉錄后階段的調控作用，揭示了蛋白質表達量同時受轉錄與轉錄后修飾共同影響的機制，為依據多組學數據的大豆智能設計育種開辟了新思路。 

　　該項目得到農業生物育種重大專項、國家自然科學基金等項目的支持。 

　　原文鏈接：https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X（25）00182-X